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農業のGAPとは、

消費者、生産者、環境にとって、「Good」な農業の取組のことをGAP（ギャップ）といいます。
GAPは、Good Agricultural Practicesの頭文字をとった言葉で、直訳すると「よい農業の取組」という意味ですが、一般的には「農業生産工程管理」と呼ばれています。
GAP は、農業生産の各工程の実施、記録、点検及び評価を行うことによる持続的な改善活動であり、食品の安全性向上、環境の保全、労働安全の確保等に資するとともに、農業経営の改善や効率化につながる取組です。

出典:農業生産工程管理（GAP）に関する情報：農林水産省